Chrome 最初に起動したオプションに倣う仕様?

デスクトップ上にあるChromeのショートカットに

"C:\Documents and Settings\Administrator\Local Settings\Application Data\Google\Chrome\Application\chrome.exe" --enable-user-scripts --bookmark-menu --omnibox-popup-count=10

同じくauoneのショートカットに

"C:\Documents and Settings\Administrator\Local Settings\Application Data\Google\Chrome\Application\chrome.exe" --enable-user-scripts --app=https://mail.auone.jp/

Chromeウィンドウが起動していない状態でChromeショートカットを実行した場合、Chromeウィンドウにブックマークアイコンが表示される。

しかしauoneショートカットから起動したChromeウィンドウが存在する状態でChromeショートカットを実行した場合、ブックマークアイコンが表示されない。

別プロセスで動作していると認識していたので起動オプションも独立していると思っていたが、最初に起動するChromeに引きずられる…ような気がする。

仕様なのかバグなのか…注意しとこ。